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Hola, soy Pablo

Pablo Ignacio Marcos López

Biotecnólogo Computacional en IRB Barcelona

Soy Biotecnólogo Computacional, y me interesan especialmente los campos del Software Libre y la Salud, así como las cuestiones éticas en torno a la Privacidad y la Inteligencia Artificial. En mi tiempo libre, contribuyo a Wikipedia y OpenStreetMap.

Programo en Python, R, BaSH y Ruby

Trabajo en Equipo
Narrativa
Hablar en Público
Escritura
Creatividad
Flexibilidad

Habilidades

Experiencias

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Institut de Recerca Biomèdica

Mayo 2023 - Presente, Barcelona, España

El IRB es una Fundación de Investigación privada que se esfuerza por desarrollar soluciones avanzadas para las necesidades médicas del futuro, especialmente en lo que respecta al cáncer.

Responsabilidades:
  • Como parte de la Rama Mechanisms of Disease, he utilizado una amplia variedad de herramientas (PQSL, Python, Apache y HTML) para mantener y actualizar Chemical Checker, un bioactivity signaturizer basado en gráficos, así como Interactome3D, un visor interactivo de interactomas, y otros sitios web del grupo.

Turing BioSystems

Febrero 2023 - Mayo 2023, Lyon, Francia

Responsabilidades:
  • En Turing Bio, trabajé en la intersección entre la Academia 🧪 y la Empresa 🏬 para seleccionar, optimizar y diseñar nuevas terapias basadas en datos existentes.

    Basándome en el trabajo realizado en el IARC, transformé bases de datos para proporcionar como input a la Plataforma de IA Interpretable de Turing, que utiliza inteligencia artificial para identificar los orígenes de una enfermedad como el cáncer, permitiendo a las compañías farmacéuticas desarrollar medicamentos enfocados en la target correcta.
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Agencia Internacional de Investigación sobre el Cáncer

Febrero 2022 - Enero 2023, Lyon, Francia

El IARC es una Agencia Especializada de las Naciones Unidas / Organización Mundial de la Salud encargada de llevar a cabo y coordinar investigaciones sobre las causas del cáncer.

Responsabilidades:
  • Como parte del OncoMetabolomics Team de la Rama Nutrition & Metabolism, desarrollé CanGraph, una utilidad en Python para estudiar y analizar metabolitos asociados al cáncer utilizando grafos de conocimiento. Esta herramienta usa distintas Bases de Datos para encontrar posibles asociaciones al cáncer en componentes del metaboloma humano.

European Engineering Learning Innovation and Science Alliance

Septiembre 2021 - Enero 2022, Unión Europea

EELISA es una alianza de las principales universidades técnicas europeas destinada a definir e implementar un modelo común de “ingeniero europeo” enraizado en la sociedad.

Responsabilidades:
  • Trabajé como parte de la Protocomunidad SSERIES (Science for a Sustainable Envision of Reality and Information for an Engaged Society) de EELISA, donde ayudé a presentar el proyecto a otras Instituciones Miembros y definí el alcance de sus proyectos, actividades y presencia en línea. También ayudé a crear un bonito sitio web para su concurso Arte y Ciencia.
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Centre Hospitalier Universitaire Grenoble-Alpes

Abril 2021 - Julio 2021, Grenoble, Francia

El CHU es el centro médico líder en Grenoble, que a su vez es una de las capitales o poles de investigación biomédica de Francia.

Responsabilidades:

Universidad Politécnica de Madrid

Junio 2020 - Marzo 2021, Madrid, España

UPM es una de las principales universidades técnicas europeas y la escuela de ingenieros más prestigiosa de la Comunidad de Madrid.

Becario en el Departamento de Matemáticas Aplicadas

Febrero 2021 - Marzo 2021

Becario en el Programa de Innovación Educativa

Junio 2020 - September 2020

  • Durante la beca de colaboración profesor-estudiante ‘Del Juego a la Teoría’, programé ‘Who’s that Function’, un juego interactivo que enseña a los estudiantes los conceptos básicos de las funciones y sus propiedades de manera atractiva e interesante, utilizando una dinámica similar al ‘¿Quién es Quién?’. El juego recibió una Mención de Honor en el concurso “Ciencia en Acción”.
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Education

Proyectos

Actualización del Chemical Checker
Actualización del Chemical Checker
Asistente de Investigación Enero de 2022 - Actualidad

Utilizando una amplia variedad de herramientas, actualicé, mantuve y corregí los recursos web del Grupo SB&NB, incluido el Chemical Checker, un signaturizador de bioactividad realmente complejo, y Interactome3D.

Trabajo en Turing BioSystems
Trabajo en Turing BioSystems
Interno Febrero de 2023 - Mayo de 2023

Basándome en el trabajo realizado en IARC, fui contratado para alimentar la Plataforma de IA Interpretativa de Turing.Bio con datos de múltiples bases de datos, permitiéndoles estudiar los mecanismos de enfermedades y proporcionar nuevas soluciones a problemas existentes, en colaboración con la academia.

Investigación del cáncer mediante bases de datos de grafos
Investigación del cáncer mediante bases de datos de grafos
Investigador Enero de 2022 - Febrero de 2023

Mi Tesis de Maestría, realizada en la Agencia Internacional de Investigación sobre el Cáncer, utiliza bases de datos de grafos para encontrar posibles asociaciones de cáncer en componentes recién descubiertos o ya existentes del metaboloma humano. Lo llamamos CanGraph.

Descubrimiento de plomo para la alopecia androgenética
Descubrimiento de plomo para la alopecia androgenética
Investigador Marzo de 2022 - Abril de 2022

Un artículo que investiga el potencial de los métodos computacionales para desarrolelar nuevos medicamentos para el tratamiento de la alopecia androgenética. Ha sido publicado por el Congreso de Estudiantes de Biotecnología

Tacroleimus y trasplante de riñón
Tacroleimus y trasplante de riñón
Investigador-Programador Marzo de 2021 - Julio de 2021

Mi Tesis de Grado analiza el efecto de las trayectorias residuales de niveles sanguíneos de Tacroleimus en la supervivencia del injerto renal. El código se puede consultar aquí, y el texto está publicado como Acceso Abierto en el repositorio de la UPM.

Cambia tu Mundo
Cambia tu Mundo
Voluntario Enero de 2022 - Junio de 2022

Trabajé como voluntario en un proyecto de Aprendizaje y Servicio en Escuelas, consistente en mentoría tecnológica para fomentar vocaciones STEM en los estudiantes.

Who's That Function
Who's That Function
Desarrolelador de Juegos Junio de 2020 - Septiembre de 2020

Un juego al estilo de “Quién es Quién” para mostrar a los estudiantes las propiedades fundamentales de las funciones. [En español]

Season of KDE 2021
Season of KDE 2021
Desarrolelador Web Enero de 2021 - Abril de 2021

Ayudé a modernizar el sitio web de Okular, el lector de documentos universal de KDE, utilizando el tema aether-sass de Carl Schwan.

Modelado de Covid usando Python
Modelado de Covid usando Python
Escritor Junio de 2020

Un artículo que mide el impacto de las medidas de restricción de movimiento en la primera ola de CoViD-19 en España [En español]. Ha sido publicado por el Congreso de Estudiantes de Biotecnología

Junta de Representantes @ UPM
Junta de Representantes @ UPM
Representante Septiembre de 2018 - Actualidad

Formo parte de la Junta de Representantes de Estudiantes de mi universidad y, como tal, parte de la Junta de Dirección del Departamento de Biotecnología y Biología Vegetal, lo que me ha ayudado a entender cómo funcionan las grandes organizaciones y, por ejemplo, cómo se aprueban los presupuestos.

Wikipedia
Wikipedia
Colaborador Mayo de 2015 - Actualidad

Contribuyo a Wikipedia, el corpus colectivo de conocimiento de la humanidad.

AULA
AULA
Voluntario Mayo de 2019

He sido voluntario en AULA, una Feria Internacional donde ayudé a informar a los estudiantes sobre sus posibilidades de carrera en las áreas de biociencias y ciencias verdes.

Reparto Solidario Universitario
Reparto Solidario Universitario
Voluntario 2017-2020

Durante más de tres años, he sido voluntario en RSU, una Actividad Reconocida @ UPM donde ayudamos a las personas sin hogar llevándoles alimentos y compañía.

OSM
OSM
Colaborador 2017 - Actualidad

Colaboro con OSM, el mayor conjunto de datos abiertos para datos geoespaciales.

Conferencia sobre Cambio Climático COP25
Conferencia sobre Cambio Climático COP25
Voluntario 2019

He sido voluntario en la cumbre COP25 sobre cambio climático en Madrid, donde aprendí de primera mano sobre los problemas de nuestro tiempo y cómo pueden resolverse con la ayuda de la ciencia. También tuve la oportunidad de ver cómo se organizan y llevan a cabo grandes eventos.

BOINC
BOINC
Voluntario 2016 - Actualidad

Contribuyo con la potencia informática no utilizada de tantos de mis dispositivos como sea posible a la red BOINC.